作物和烟草都已用于分子农业的生产。烟草特别适合于生物医药业，青霉素皮试仪有人预测，到2010年，烟草植物作为生物药品原料的将大大高于作为烟草本身的。湖北枫树纺织公司实施战略工程挑战与机遇分子农业大规模生产面临的挑战与转基因食品生产所面临的挑战相同，但是大的挑战是如何使农民和公众对分子农业的安全性持有信心。

　　对于转基因作物，人们尚还进行了长期的规模的大争论；对于植人人体基因的作物或者用这种作物生产出的保健产品，我们不难想象世界上一些激进的组织和媒体将会做出如何激烈的反应。激进分子已经对分子农业进行了一些抗议活动，但是他们的抗议活动被整个转基因问题所掩盖。“绿色和平”环保组织明确表示，该组织反对任何转基因作物的推广，因此正在紧密观察分子农业的发展。“绿色和平”组织认为，自从1992年以来，美国每年都对可以生产出乙型肝炎疫苗、预防疤疹和其它疾病的人体抗体以及人体血蛋白的植物进行开放田间试验。

　　世界上已经进行过开放式田间试验的国家有美国、法国、加拿大、澳大利亚以及南美洲、南太平洋和加勒比海地区的一些国家。根据美国生物技术工业贸易协会的统计，迄今为止，美国农业部批准的旨在生产药品的植物种植面积还不足20公顷。在分子农业迅速发展的美国，包括“全国玉米生产商协会”和“美国农场局”在内的一些农业组织都对分子农业表示出谨慎的热情；但是，一些环保人士和食品加工商对此则表示担忧。

　　有些人正在对生物技术行业施加压力，要求使用非食品植物（例如烟草）以防发生交叉混合，要求分子农业生产脱离食用作物种植区，要求联邦政府实施严格的法规和监督管理。

　　2002年，美国一家名为“ProdiGene”的从事分子农业的公司被指控误将用于生产药品的试验性转基因玉米放人商业配送储备中。美国食品加工商协会对这一事件的发生表示了极大的担忧，同时指出志愿性保护措施还不足以确保食品供应的完整和安全。1999年，在美国华盛顿特区召开的生物治疗学会议上，美国一家咨询公司的总裁预言道：“未来的农业生物技术不但将用于生产食品，还将使用可再生、没有污染的资源，生产出富有创意的产品。

　　这些富有创意的产品将会与当前的塑料和计算机一样成为人类生活的重要组成部分。“为了实现上述预言，人类还要掌握许多新知识和新技术，特别是要防止分子农业生产与食用粮食供应交叉混合在一起。

　　近年来，针对市场实际一，湖北枫树纺织制，使产品在价格上有较大的竞争优势。枫树公司参照1509002国际质量体系认证标准，制定了详尽的生产管理标准细则，并花巨资购进瑞士、日本和台湾等国家和地区的生产设备，在生产过程中实现了电脑配色自动化，保证了产品同色度无差异，质量达到国际水准。与此同时，该公司还加大了技术创新步伐，大胆引进技术人才，从香港、上海等地高薪聘请技术行分公司式产品推介、营销计划。

　　如今，“枫树”牌已成为湖北省驰名商标，“枫树”牌涤纶线已获得了“湖北省产品奖”、“湖北工业精品奖”，并通过了1509002国际质量体系认证。此外，为不断提高“枫树，，知名度，枫树公司还启动新的CI形象工程，统一路牌、车身、市场广告的设计制作，并通过电视、报刊等新闻媒体对其产品进行广泛宣传，逐步树立了”枫树“的品牌形象。